Se evaluaron los contenidos biodisponibles de zinc, hierro, manganeso, cobre, cromo, cadmio, plomo y níquel en sedimentos superficiales entre 10-20 cm. de profundidad en 10 estaciones de muestreo de la laguna Bocaripo y 10 estaciones de muestreo de la laguna Chacopata, usando espectrofotometría de absorción atómica. Además, se evidenció la importancia de la influencia que pueden tener los contenidos de las partículas, según sus diámetros; el contenido de materia orgánica total y el pH de los sedimentos sobre las concentraciones biodisponibles de metales traza en los periodos climáticos: finales de lluvia (Nov. 2003), sequía (Mar. 2004) y lluvia (Jul. 2004). Para sedimentos superficiales de la laguna Bocaripo se determinaron contenidos promedios de metales traza biodisponibles (mg/kg. masa seca) de Fe (62,15), Zn (5,13), Cd (0,05), Cr (0,15) y Ni (0,04) que fueron mayores a los obtenidos para la laguna Chacopata, la cual presentó concentraciones más elevadas de Pb (6,30), Mn (5,72) y Cu (0,32). Se observaron diferencias estadísticas significativas para Fe, Pb y Mn entre los períodos climáticos estudiados en la laguna Bocaripo; no obstante, Cr y Mn fueron estadísticamente diferentes entre estaciones de muestreo, lo que también fue observado en la laguna Chacopata para las concentraciones de Fe, Cu, Mn y Zn. El contenido biodisponible de hierro en la laguna Bocaripo puede representar un riesgo potencial de contaminación, ya que en ambientes muy reductores pueden afectar la movilidad de otros metales hacia la solución por crear condiciones más oxidantes que conllevan a acidificar fuertemente el ambiente.