La reducción microbiana de sulfatos es desarrollada por microorganismos reductores de sulfatos y es un proceso vital en ambientes marinos y estuarinos, pues explica hasta un 50% de la tasa de la degradación de la materia orgánica en condiciones anaeróbicas. Dada la importancia de este grupo microbiano, se consideró necesario el desarrollo de la presente investigación con el fin de analizar la diversidad y densidad de especies y la posible influencia de algunas variables fisicoquímicas sobre sus números. Se tomaron muestras de sedimentos en seis estaciones, se midieron in situ la temperatura, el pH y la salinidad. Se cuantificaron las bacterias sulfato-reductoras en medio Postgate. Las especies identificadas en casi todas las estaciones fueron: Desulfovibrio vulgaris, D. carbinolicus, Desulforomonas acetoxidans y Desulfobulbus elongatus: Desulfobacter curvatus y Desulfococcus multivorans se encontraron con menos frecuencia y Desulfovibrio africanus sólo se halló en una de las estaciones. La dinámica poblacional de estas bacterias pudo estar influenciada por fenómenos de surgencia, la textura del sedimento y principalmente por el aporte de materia orgánica debido a la descarga de aguas residuales. Los recuentos de bacterias sulfato-reductoras variaron estadísticamente muy significativamente entre estaciones (P< 0,05) del pH con la densidad de bacterias sulfato-reductoras.