La composición, abundancia y variación espacio-temporal del zooplancton fueron estudiadas en 5 ecosistemas marinos del Parque Nacional Archipiélago Los Roques, durante las épocas de sequía y lluvia de 2000. Las muestras se tomaron con una red de plancton (Øporo = 285 ¼m) entre 6 y 0 m de profundidad. Análisis multivariante relacionaron la salinidad, transparencia, profundidad y temperatura del agua. Los copépodos (57 especies) constituyeron el grupo zooplanctónico dominante y permanente, seguidos por los apendicularios, gastrópodos del holoplancton y larvas meroplanctónicas. Los valores máximos de densidad zooplanctónica se obtuvieron en el mes de mayo (época seca) y el mínimo en el mes de noviembre. La laguna Central y la zona de manglar presentaron la mayor abundancia del zooplancton y en ambas la transparencia y profundidad resultaron mínimas, mientras que la menor abundancia y riqueza se registraron en la Barrera Este. La composición y abundancia del zooplancton en los diferentes ambientes estudiados estuvo integrada por especies neríticas y oceánicas de aguas superficiales y profundas. Las diferencias espaciales y temporales del zooplancton se relacionaron principalmente con la transparencia y la salinidad y estuvieron sujetas a la estacionalidad climática (sequía y lluvia) que opera en el Parque Nacional Archipiélago Los Roques.