El fitoplancton es una comunidad biótica que junto al fitobentos constituyen la base de las tramas tróficas acuáticas, siendo responsables de la mayor parte de la producción primaria oceánica. Conocer su composición permite complementar las evaluaciones de calidad del agua, ya que son indicadores excelentes de las condiciones ambientales. En este trabajo, se planteó analizar la estructura comunitaria del microfitoplancton y su asociación con variables físicas y químicas de la zona marina y costera entre Cabo Codera y Paparo, incluyendo dos ríos importantes, en el municipio Brión del estado Miranda. Muestras de fitoplancton fueron obtenidas con redes de arrastre y botellas en seis estaciones durante el período abril 2010 - abril 2011 para la estimación de la composición y abundancia de las microalgas. Variables físicas y químicas del agua fueron estimadas. Un total de 140 especies fueron identificadas, distribuidas en diatomeas (66 %), dinoflagelados (27 %), clorofitas (2 %), cianobacterias (2 %), euglenofitas (2 %) y flagelados (1 %). Se observó una distribución de los organismos definida por el patrón continente-océano, en la que las estaciones fluviales estuvieron representadas en su mayoría por diatomeas, mientras que en las estaciones marinas, se observó un porcentaje alto de dinoflagelados en algunos meses del año. La riqueza y el índice de biodiversidad fueron más altos en las estaciones marinas que en las fluviales. Se pudo apreciar que la surgencia costera incide sobre la distribución del microfitoplancton marino durante los primeros meses del año, mientras que en la época de altas precipitaciones, el aporte de los ríos influye sobre su composición.